Melkio mokyklos dienotvarkėje stengiamės darniai paskirstyti dėmesį fiziniam, protiniam, kūrybiniam ir jausminiam ugdymui, atsižvelgdami į vaikų raidos etapus ir asmenines savybes.
Kiekvienas rytas prasideda bendru pasisveikinimu lauke, mankšta ir bėgimu. Pirmų ir antrų klasių mokiniai kartu su mokytojais bėga pusantro kilometro, trečių-ketvirtų klasių – tris kilometrus, penktų ir vyresni – keturis. Tokie atstumai pasirinkti stebint vaikų savijautą ir ieškant tinkamiausio krūvio, leidžiančio ugdytis fizinę ištvermę ir komandiškumą.